
His-Cys-Lys-Phe-Trp-Trp 是人类免疫缺陷病毒 (HIV) 整合酶的抑制剂,IC50 为 2 μM。
基本信息
- 英文名称:HIV Integrase Inhibitor Peptide,His‑Cys‑Lys‑Phe‑Trp‑Trp
- 中文名称:HIV 整合酶抑制多肽,人免疫缺陷病毒 1 型整合酶抑制六肽
- 氨基酸全序列:His‑Cys‑Lys‑Phe‑Trp‑Trp
- 单字母序列:HCKFWW
- 三字母序列:His‑Cys‑Lys‑Phe‑Trp‑Trp
- 分子量:906.06
- 分子式:C₄₆H₅₅N₁₁O₇S
- CAS 号:172546‑75‑7
- 等电点:理论 pI 约 9.47,属于碱性多肽,序列含组氨酸、赖氨酸两个碱性残基,无强酸性侧链氨基酸,生理 pH 条件下携带净正电荷。该多肽为人工固相合成的六肽,是针对 HIV‑1 整合酶的多肽类抑制剂,N 端与 C 端均为游离末端,无乙酰化、酰胺化等化学修饰。
结构信息

该多肽为线性六肽,仅含 1 个半胱氨酸残基,无链内二硫键;N 端为游离组氨酸氨基,C 端为游离色氨酸羧基,两端均无化学修饰。
序列中包含两个连续色氨酸残基与一个苯丙氨酸残基,疏水芳香侧链占比高,是与靶蛋白结合的主要疏水作用位点;赖氨酸侧链提供正电荷,介导与整合酶表面酸性区域的静电相互作用;半胱氨酸侧链巯基可参与氢键形成,同时易发生氧化生成二硫键,形成多肽二聚体。
水溶液环境下,多肽因疏水残基堆积呈现一定构象倾向,整体以柔性无规卷曲为主,不存在稳定的 α‑螺旋或 β‑折叠二级结构;结合 HIV 整合酶活性位点时,肽链发生构象重排,适配蛋白结合口袋。
多肽两端均为游离末端,对氨基肽酶、羧基肽酶敏感,在血清、细胞裂解液等含蛋白酶体系中易被降解;半胱氨酸巯基暴露于空气时易氧化失活,整体化学稳定性弱于末端封闭的合成多肽。
作用机理
该多肽是 HIV‑1 整合酶的竞争性抑制剂,体外对整合酶的抑制活性 IC₅₀约为 2 μM。HIV 整合酶是病毒复制周期的关键酶,负责完成病毒 cDNA 的 3' 端加工与链转移两步核心反应,将病毒基因组共价整合入宿主细胞染色体。
多肽通过结合整合酶的催化核心结构域,竞争性占据整合酶与病毒 DNA 的结合界面,阻碍病毒 DNA 末端与整合酶活性位点的结合,同时干扰整合酶的金属离子配位环境,从而同时抑制 3' 加工反应与链转移反应,阻断病毒 DNA 整合到宿主基因组的过程,终止病毒复制周期。
多肽的芳香族残基嵌入整合酶的疏水结合口袋,提供疏水堆积与 π‑π 相互作用;碱性赖氨酸侧链与整合酶表面酸性氨基酸残基形成静电相互作用,共同维持结合亲和力。该多肽特异性作用于整合酶,对 HIV 逆转录酶、蛋白酶无明显抑制活性。多肽被蛋白酶水解后,完整结合表位被破坏,丧失抑制活性;半胱氨酸氧化形成二聚体后,抑制活性也会显著下降。
研究进展
该多肽最早通过噬菌体展示多肽文库筛选获得,是早期被鉴定的 HIV 整合酶多肽类抑制剂之一。早期生化实验验证其可同时抑制整合酶介导的 3' 加工与链转移反应,在微摩尔浓度下即可发挥阻断效应,为解析整合酶的催化机制提供了工具分子。
后续研究将其作为模式抑制剂,用于探究整合酶与 DNA 的结合模式、催化活性位点的结构特征,以及整合酶抑制剂的构效关系。受限于多肽本身的固有缺陷 —— 细胞膜穿透能力弱、体内易被蛋白酶快速降解、口服生物利用度极低,该分子未进入药物开发流程,未开展动物体内药效与临床研究。
除抗病毒研究外,因分子含半胱氨酸巯基,该多肽也被部分研究用作巯基化合物模型,用于自由基清除反应动力学的体外测试,但这一应用并非其核心研究方向。目前该多肽主要作为经典的整合酶多肽抑制剂,用于体外生化水平的整合酶功能与抑制剂筛选研究。
相关应用
作为科研工具多肽,用于 HIV‑1 整合酶体外酶活测定实验,作为阳性对照抑制剂,用于整合酶催化活性定量、酶动力学参数测定。
用于 HIV 整合酶结构与功能研究,解析整合酶催化核心域的结合口袋特征、DNA 结合机制,以及金属离子对酶活的调控作用。
用于抗 HIV 药物研发的体外初筛体系,作为参比抑制剂,评价新型小分子或多肽类整合酶抑制剂的效价强度。
仅限体外生化与分子生物学实验使用,因细胞膜穿透能力差、体内稳定性不足,不适合细胞内给药、动物体内给药,不用于人体临床治疗。
溶解保存
- 溶解:多肽含较多疏水芳香残基,水溶性中等。可先用少量二甲基亚砜助溶,再用纯水、PBS 缓冲液或 Tris‑HCl 缓冲液梯度稀释至工作浓度;也可使用稀醋酸水溶液直接溶解。操作过程尽量减少暴露于空气,避免加入氧化剂,防止半胱氨酸巯基氧化形成二聚体;避免强碱、高温条件,防止肽键水解断裂。
- 保存:冻干粉末密封、避光条件下‑20℃干燥长期保存,充氮隔绝氧气可进一步提升稳定性;水溶液分装为小份后‑20℃或者‑80℃冻存,严格避免反复冻融。因巯基易氧化,水溶液状态下稳定性差,建议现配现用;接触蛋白酶的生物样本体系必须临用前配制。
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